Na uitgebreide opleidingen als meubelmaker was Henk van Eeken werkzaam bij enkele orgelmakerijen, waar hij onder andere pijpenmaken en klankgeving leerde. In 1982 vestigde hij een orgelmakerij te Leusden.

In de nacht van 11 op 12 april 1995 legde een felle brand de werkplaats te Leusden voor het grootste deel in de as. Nadat Henk van Eeken in maart 1996 orgelmaker Blank heeft overgenomen, zijn de bedrijfsactiviteiten in de grote en goed geoutilleerde werkplaats in Herwijnen voortgezet.

Doel van het bedrijf is om vanuit de hedendaagse behoefte orgels te maken die wat betreft klankexpressie, duurzaamheid en artistieke zeggingskracht gelijkwaardig zijn aan de fraaie instrumenten uit de historie.

Om dit doel te kunnen bereiken wordt er veel onderzoek verricht aan historische orgels. Aangezien research de basis van de bedrijfsvoering is, heeft dit onderzoek een permanent karakter. Door samenwerking met de Universiteit van Göteborg en GOArt, het Göteborg Organ Art Center te Göteborg, Zweden, heeft deze research inmiddels een wetenschappelijke basis gekregen. Daarbij worden de modernste research-methoden gebruikt, zoals SIMS-techniek en computer-modelling.

Als gevolg van deze research past Henk van Eeken het principe van procesreconstructie toe, met name bij het vervaardigen van de orgelpijpen. Dat wil zeggen, dat het oorspronkelijke historische produktieproces per bouwstijl zo nauwkeurig mogelijk wordt herhaald. Daarbij worden grondstoffen gebruikt, met een chemische samenstelling die sterk overeenkomt met het historische metaal. Afhankelijk van de gekozen bouwstijl wordt het metaal op een zandbed of op doek gegoten en vervolgens handmatig afgeschaafd. Een zo nauwkeurig mogelijke herhaling van het oorspronkelijke productieproces biedt de beste voorwaarde om een klankkwaliteit te bereiken, die gelijkwaardig is aan die van historische orgels.

Henk van Eeken is de Nederlandse partner van ORSEV - The Organ as a Symbol of the European Vision (het orgel als symbool van de Europese gedachte), een project binnen het culturele programma Raphael van de Europese Commissie (DG X). Hij is lid van de raad van advies van het Instituto de Órganos Históricos de Oaxaca in Mexico en was in 2000 en 2002 jurylid voor de Arp Schnitger Preis, een tweejaarlijkse prijs, die wordt toegekend door de Arp Schnitger Gesellschaft. Ook werkt Henk van Eeken mee aan het onderzoeksproject COLLAPSE - Corrosion of Lead and Lead-Tin Alloys of Organ Pipes in Europe - een project binnen 'The Fifth Framework Programme' van de Europese Commissie.

Henk van Eekens organisatie wordt gevormd door 9 specialisten, met een gezamenlijke ervaring van meer dan 140 jaar.

Met de nieuwe orgels die sedert 1982 zijn vervaardigd, heeft Henk van Eeken een internationale reputatie verworven. Ook hebben Henk van Eeken en zijn medewerkers belangrijke historische orgels gerestaureerd zoals het orgel in de Hervormde Kerk te Zwartewaal (1902), het orgel in de Oud-Katholieke Kerk te Dordrecht (1844), het Zeemans-Schmidt orgel in de voormalige Hervormde Kerk te Etten-Leur (1699) en het Radeker/Garrels-orgel in de Hervormde Magnuskerk te Anloo (1719).

Daarnaast is er een groot aantal orgels in onderhoud, waaronder belangrijke instrumenten als het Vater-Müller (1726 -1742) orgel in de Oude Kerk te Amsterdam, het Christian Müller orgel (1734) in de Waalse Kerk te Amsterdam en het Jalinck orgel 1708 in de Hervormde Kerk te Westervoort. Daarbij wordt een actief stem- en onderhoudsbeleid gevoerd, waarbij de belangen van de opdrachtgever centraal staan.